A presente invenção se refere a um processo de obtenção de heliotropina (piperonal) por uma rota natural, através da oxidação microbiológica do isossafrol nas formas diasteroisoméricas E e Z, no qual microorganismos e enzimas presentes nos ditos microorganismos são utilizados como agentes catalizadores na presença de peróxido de hidrogênio em meio aquoso, e em condições de temperatura, agitação e pH controlados.